Vor 16 Mio. Jahren war die heutige Karstlandschaft Meeresboden. Muschelschalen, Fischknochen und die Überreste anderer Meeresbewohner türmten sich kilometerhoch auf. Die Ablagerungen wurden zerrieben, unter Druck zu Kalkstein verdichtet, von Sandstein bedeckt und schließlich über den Meeresboden gehoben. Pflanzenwurzeln und Regenwasser schufen ein weit verzweigtes Höhlensystem mit unterirdischen Wasserläufen. Bester Ausgangspunkt für die Erkundung ist das Waitomo Glowworm Caves Visitor Centre (39 Waitomo Village Rd.).